本发明公开了光伏电池阵列技术领域的一种光伏阵列故障缺陷诊断系统及方法，包括：采集光伏阵列中各个光伏电池串的电压和电流值；比较采集到的电压值大小，查找出电压值最小的电池串及其电流电压值；计算电压值最小的电池串电压值与正常运行下电压值的差值，判断该差值是否超出正常偏差；响应于差值没有超出正常偏差时，重新采集光伏阵列中各个光伏电池串的电压和电流值以继续监测；响应于差值超出正常偏差时，将电压值最小的电池串放入疑似故障组中进行二次故障电池串判断。本发明通过将传统的电压、电流定位法、时间跟踪法和光伏电池诊断模型相结合，从而能够基本判断故障的类型和位置。