本发明公开了一种面向调控主站验收的厂站自动化自助调试系统及方法，该系统包括部署于厂站侧的服务终端与至少一个移动终端；服务终端用于对调试过程进行管理，以及为移动终端提供厂站自动化系统上送的数据，移动终端用于配置及执行调试项目。移动终端可实现远动调试功能、PMU调试功能、告警直传调试功能、远程浏览调试功能、一键顺控调试功能、网络安全监测调试功能、远程维护调试功能、电量调试功能、保信调试功能、AGC调试功能、AVC调试功能及一次调频调试功能等。本发明实现了面向调控主站验收的厂站自动化应用功能自助式便捷调试，适用于实验室检测与现场调试，测试结果可靠，解决了目前主子站间协同应用测试效率低的问题。