本发明提供了一种空心电抗器匝间绝缘缺陷的定位系统及方法，该定位方法包括如下步骤：获取第一电抗器上多个预设位置点在预设幅值频率的脉冲电压下的实时磁感应强度值；获取第一电抗器上多个预设位置点在预设幅值频率的脉冲电压下的多个历史磁感应强度值；计算每个预设位置点的多个历史磁感应强度值的第一磁感应强度平均值；计算实时磁感应强度值与对应的第一磁感应强度平均值之间的第一比例值并根据第一比例值对第一电抗器的匝间绝缘缺陷进行定位。本发明可以根据第一比例值对第一电抗器的匝间绝缘缺陷进行定位，其解决了现有脉冲振荡电压法仅能发现空心电抗器是否存在匝间绝缘缺陷，而无法对匝间绝缘缺陷进行定位的问题。