本发明公开了网络安全技术领域的一种面向工控系统组态工程文件的保护方法及套件，方法包括：对编写好的工控系统组态工程文件进行加解密，获得第一工控系统组态工程文件和加解密密钥，加解密密钥包括密码和salt值；对密码进行再次加解密，并保存在第一工控系统组态工程文件中，生成第二工控系统组态工程文件；收到忘记密码的用户发送的第二工控系统组态工程文件的厂商通过私钥解密出密码。本发明提高了组态工程文件的加密强度，可以防止常规的暴力破解攻击，降低了组态工程的泄密风险。