本发明公开了一种考虑谐波抑制的可再生能源制氢系统并/离网无缝切换控制方法及装置。首先根据可再生能源制氢系统在两种运行模式下不同的谐波特性和控制目标，提出适用于孤岛模式的阻抗调节控制策略，以及适用于并网模式的谐波补偿控制策略。随后，对建立起孤网电压和频率的储能变流器引入改进电压外环和改进锁相环的方法，实现可再生能源制氢系统母线电压在切换过程中的平滑过渡。该方法可实现在非线性制氢负载及谐波电网下，可再生能源制氢系统并网/孤岛工作模式之间的无缝切换，为可再生能源制氢设备在并网/孤岛两种工作模式下的安全运行提供参考。