一种互联电网发电与备用联合优化方法、系统及存储介质，方法包括根据互联电网发电‑备用联合优化模型进行联合优化，判断是否包含迭代反馈的约束：若是，则直接进行不同场景下的备用可用性检验，若否，则先生成备用调用场景，然后进行场景筛选和压缩，再进行不同场景下的备用可用性检验；判断能否通过备用可用性检验以及是否不具备调整空间：若二者满足其一，则结束优化，否则构建不可行场景下的备用约束添加至互联电网发电‑备用联合优化模型，利用互联电网发电‑备用联合优化模型再次进行联合优化，循环迭代，直至不存在风电和常规负荷的削减补偿或不再具备新的投运机组为止。本发明实现了计及安全风险的多区域联合优化，计算效率高。