本发明公开了一种治疗急性肺损伤的中药组合物及制备方法和应用，属于中药复方制剂技术领域。本发明治疗急性肺损伤的中药组合物，由以下重量份的原料药制成：生麻黄5～20份、升麻5～20份、当归5～30份、知母5～30份、玉竹5～40份、黄芩5～30份、白芍5～30份、天冬5～40份、青蒿5～40份、鳖甲5～40份、草果5～20份、厚朴5～30份、生石膏5～50份、苍术5～40份、甘草5～20份。本发明通过调节肠道菌群的结构分布及组成，并通过上调机体的免疫反应，防止病原菌定殖。改善肠道菌群的失调，增加可产生短链脂肪酸的有益菌群、抑制有害菌群，起到调整菌群的积极作用。对急性肺损伤有具有明显的治疗效果，具有良好的临床应用前景。