本发明提供了一种轨道衔接结构、交叉轨道及运输系统，所述轨道衔接结构包括：第一安装座；设置在第一安装座上的第一承托件，第一承托件嵌设在轨道上，第一承托件上设有连接槽，连接槽沿轨道的纵长延伸方向设置，连接槽的两端均与轨道相接；以及设置在第一安装座与第一承托件之间的高度调节结构，高度调节结构用于调节连接槽的设置高度。所述轨道衔接结构设置在轨道交叉处，用于消除轨道交叉处的断开处，可在第一承托件上设置多个连接槽，连接槽分别连接对应的轨道用于供运输车的辊轮通过，使得运输车能够平顺地在各轨道上行进。本发明还提供了一种交叉轨道及运输系统，通过运用前述轨道衔接结构使得运输车能够更加稳定地运行。