本发明提供一种考虑最小扰动和最大收益的多星应急任务调度方法、系统、存储介质和电子设备，涉及多星应急任务调度技术领域。本发明中，获取卫星资源集合和待观测的应急任务集合，所述卫星资源集合中任一卫星上的初始任务调度序列均为常规任务；根据所述应急任务集合，采用精英选择策略确定一待调度应急任务；根据所述初始任务调度序列和待调度应急任务，结合预设的考虑最小扰动和最大收益的多星应急任务调度模型，获取多星应急任务调度序列。设计精英选择策略选择待调度应急任务，保证收益值高的任务能被优先安排调度，收益值较低的任务也具有观测机会，利于整体寻优。