一种地下水资源实时监测系统和方法，所述方法包括按照预设条件在目标区域布置钻孔；确定孔数据，其中孔数据包括孔深、钻空位；在布置钻孔的位置处对应布置监测装置，监测装置中设置有声呐系统；对水下物体进行监测；建立布置有钻孔位置坐标的相对坐标系；基于预设的声呐声场轨迹路径进行建模和模拟，并进行实际测量；绘制地下水温场景图和地下水流场景图，对地下水资源数据的分析处理，将地下水温场景图和地下水流场景图进行整合，得到地下水资源实时监测场景图进行展示。该方法可以实现对地下水资源的实时监控，并且可以提高水资源采集数据的传输速度和效率，保证高精度，高速率的实时监测。