本发明属于野生传粉蜂驯化繁育技术领域，具体公开一种短头熊蜂人工种群构建的方法，通过营造适宜生境，诱捕野生短头熊蜂蜂王(F0代)，饲养成群后，统计繁育特性筛选优良种群，选择蜂王产卵前期小于30天，工蜂数量大于300头的健康蜂群培育子代，子代蜂王数量大于30头的蜂群为种群，结合家系遗传图谱，组织交尾，避免同群近交，F2代时重复引入野生种群F0代筛选优良子代与F3代进行杂交复壮种群，F3代以后，每间隔2代，引入一次F0代进行复壮。逐代筛选，引种复壮，保持人工种群的稳定，持续饲养若干个世代，逐代优选易于人工环境饲养、群势较强且性情温驯的短头熊蜂家系，可生产大量优质蜂王，为短头熊蜂工厂化周年繁育提供种源保障。