本发明公开了一种中药提取物脂质体的制备装置及其制备方法，该制备装置包括对撞射流器，具有呈镜像对称设置的油相通道和水相通道；增压组件，具有第一增压机构、第二增压机构，第一增压机构通过单向阀与油相通道连接，第二增压机构通过单向阀与水相通道连接；油相储存罐，与第一增压机构连接；水相储存罐，与第二增压机构连接；其中，对撞射流器还具有对撞室，对撞室位于油相通道、水相通道的交汇处；对撞室的上侧设置有循环通道，下侧设置有排料通道，排料通道分流一支与循环通道连通，循环通道上设置有循环泵。该制备方法通过该制备装置实现。本发明可将不同中药材的水溶性提取物、脂溶性提取物包封在同一脂质体中，得到多种功效的脂质体。