本发明涉及水稻育种技术领域，具体公开了水稻根系伸长调控基因OsDRP1C的突变体、蛋白质、表达载体及其应用。基因OsDRP1C在调控水稻根系生长中的应用，通过其DNA序列中一个或几个碱基对错义突变，调控水稻根系的生长；基因OsDRP1C在TIGR中的编号为LOC_Os03g50520，含有如SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列。本发明通过调控TIGR中的编号为LOC_Os03g50520的基因OsDRP1C，通过其DNA序列中一个或几个碱基对错义突变，抑制或促进水稻主根、不定根、侧根和根毛细胞的伸长，可实现对水稻根系生长性能的调整。