本发明提供一种保护bootloader及其环境变量的方法及系统，可在保证安全性的前提下，可以保护bootloader及其环境变量不被篡改。所述方法包括以下步骤：获取加密后的bootloader的镜像；所述加密后的bootloader内存储有加密后的内部环境变量；对加密后的bootloader的镜像进行验签；若验签失败，阻止系统启动；若验签成功，则在bootloader运行时对内部环境变量进行解密。采用本方法，可以有效提高安全性，保护bootloader及其环境变量不被篡改。