本发明公开了一种变质岩潜山油藏勘探目标确定方法及装置，其中该方法包括：获取设定的研究区中每个成藏要素相比于所有成藏要素的相对重要程度等级，形成对比矩阵；利用对比矩阵中每个成藏要素相比于所有成藏要素的相对重要程度等级计算特征向量，作为该成藏要素的权重；根据潜山圈闭、烃源灶、区域盖层和岩石矿物的分布特征分别确定油气藏储层在单因素控制下的第一、第二、第三和第四成藏概率；根据第一成藏概率、第二成藏概率、第三成藏概率、第四成藏概率和各成藏概率对应成藏要素的权重，确定变质岩潜山油藏的综合成藏概率；将综合成藏概率高于概率阈值的区域确定为变质岩潜山油藏的勘探目标区域。本发明可以准确、可靠的确定勘探目标。