本发明公开了一种基于图数据库的电网网络安全分析方法及系统，其方法包括：采集各种电网网络安全数据，对所述安全数据进行去噪去重处理后存储到数据库mysql中；采用多线程并行的方式，将数据库mysql中每个数据表通过单独线程加载到内存集合；在内存合集中构建各类节点和关系形成Neo4jCypher语句；基于Neo4jCypher语句通过图数据库Neo4j全量和增量构建知识图谱；编写DockerFile文件将上述步骤打包成镜像，运行到docker容器中实现快速部署；本发明能够提高攻击链路溯源能力以及部署灵活性和拓展性。