本申请提出了一种自动调频煤层脉冲注水方法，包括以下步骤：a、在设定频率范围内循环激振煤体；b、记录所述煤体的自振频率；c、将实时监测的所述煤体共振频率反馈至脉冲水泵，使脉冲水击与所述煤体保持共振状态；d、注水结束。在注水过程中，通过在设定频率范围内循环激振煤体，并记录煤体的自振频率，可以实时监测煤体受润湿状态等因素影响带来的自身共振频率的变化，同时，将实时监测的煤体的共振频率反馈至脉冲水泵，以保持脉冲水击与煤体的工作状态，从而促进煤层注水润湿及防尘效果。