本发明提供一种水工混凝土结构温度仿真一致性检验方法和系统，包括以下步骤：步骤一：混凝土实际温度测点获取；步骤二：混凝土实测温度获取；步骤三：仿真计算温度测点获取；步骤四：仿真计算测点温度获取；步骤五：测点温度一致性验证标准；步骤六：测点温度一致性检验；步骤七：区域温度一致性检验；步骤八：整体温度一致性检验；步骤九：当上述温度测点、区域温度、整体温度均满足一致性要求时，温度仿真结果与实测温度是一致的。本发明提供一种水工混凝土结构温度仿真一致性检验方法及其检验系统，属于水利水电技术领域。