本发明公开了一种PCB电镀槽用杀菌除藻剂及其制备方法、杀菌除藻方法，杀菌除藻剂包括以下质量百分数的各组分：8.0%~10%的乳化剂、1.0%~2.0%的助剂、0.5%~2.0%的稳定剂和0.5%~1.5%的加速剂，余量为溶剂；所述乳化剂为葡萄糖腙类化合物，所述助剂包括司盘类化合物和聚乙二醇类化合物；所述稳定剂包括双酚芴、2,5‑二羟基苯硫酚和4‑苯氧基苯硫酚中的至少一种；所述加速剂包括二乙基二硫代氨基甲酸铵、二硫代氨基甲酸铵和吡咯烷二硫代甲酸铵中的至少一种。本发明的杀菌除藻剂能对电镀槽进行有效杀菌和除藻，解决藻类和菌类对电路板带来的不良影响。