本发明实施例公开了一种制冷系统的变频压缩机控制方法、装置及制冷系统。该方法包括：根据各间室的实际温度，确定各间室的实际温度与相应的预设目标温度的温度差；当至少一个电磁阀为导通状态时，若导通状态的电磁阀对应的间室的温度差超过预设第一温度差阈值，或对应的间室的加热器的加热输出量低于预设加热量阈值，则控制变频压缩机的转速上升第一预设转速值；当至少一个电磁阀为导通状态时，若导通状态的电磁阀对应的间室的温度差低于预设第二温度差阈值，或对应的间室的加热器的加热输出量高于预设目标参考值，则控制变频压缩机的转速下降第二预设转速值。本发明实施例提供的技术方案，能够实现变频压缩机实际转速与实际负荷匹配，降低能耗。