本发明提供了一种异养反硝化脱氮载体及其制备方法和使用方法，该载体为双层结构，包括：载体内核，所述载体内核包括质量占比分别为：65%~90%、5%~30%和1%~10%的固体缓释碳源、磁性粒子和粘合剂；及消耗外层，所述消耗外层覆于载体内核外部，包括质量占比分别为：70%~95%、0.5%~25%、0.5%~8%和0.5%~8%的固体缓释碳源、磁性粒子、粘合剂和成孔剂；其中，载体内核中磁性粒子的质量占比大于或等于消耗外层中磁性粒子的质量占比。该载体可应用于异养反硝化生物脱氮处理污水，因其载体内核具有磁性，消耗后的小粒径载体易于被回收再利用，避免系统发生短流或堵塞的问题；同时可通过磁热效应由载体内部进行加热，促进微生物脱氮反应，适用于快速启动和低温条件下使用。