本发明提供了一种双金属位点纳米酶及其制备方法和应用，该双金属位点纳米酶的活性中心包括两个金属原子，两个所述金属原子之间的距离为金属原子能够破坏流感病毒的囊膜结构从而发挥抗病毒活性，并且在低温条件下抗病毒活性不受影响；双金属位点纳米酶发挥脂质氧化酶活性，其抗病毒的机理不受病毒突变的影响，因而能够有效阻断流感病毒的传播；并且可以将Fe2ONC纳米酶作为一种新型的抗流感病毒材料应用于空气净化装置中，以提高空气净化器对流感病毒的过滤效果，从而为流感病毒的防控提供新的策略。