本发明公开了一种灌区水费征收管理系统及测算方法，所述系统包括信息采集装置，用于采集灌区闸门和泵站的水量数据；云服务器，用于存储各类水量数据，以及根据预设算法进行分析运算；终端设备，用于管理各类数据，以及发布信息。本发明通过设置智能化信息化管理系统，从而对灌区用水情况进行实时监测，实现农业用水量精确计量，实现供水成本核算，为合理制定或调整水价提供依据，保证了有效灌溉面积范围内，总体不增加农民负担情况下逐步推进农业水价形成机制建设。达到了灌区供用水管理可视、可测、可控的目标，有效的节约时间、人力和物力，提升了灌区管理智能化和科学化。