本发明公开了一种恢复鱼类生物多样性的物种池方法，涉及生态环境保护技术领域，包括物种池构建：在河流的河漫滩上沿河流流向，就地取材堆砌构建不同形状、面积的多个物种池，在各物种池中设置与河流干流连通的物种池入口和物种池出口，塑造适合不同种类鱼类产卵和栖息的水文条件；物种池连接：将同侧的相邻的两个物种池之间通过生态廊道连接，使鱼类能够在不同的物种池之间游动；越冬场所构建：在河流干流河道内沿河流流向挖设多个深潭，为鱼类提供越冬场所。本发明提供的恢复鱼类生物多样性的物种池方法，能够有效提高河流全流域的鱼类多样性水平。