本发明提供了一种阿卡波糖发酵液的预处理及过滤方法，通过适当的预处理方法，将阿卡波糖发酵液中的水溶性蛋白质等影响过滤的杂质先进行沉淀，再絮凝其他蛋白和菌丝，通过板框压滤的方式得到滤液，由于板框压滤过程基本不产生热量，全程不需要对料液进行冷却处理，板框压滤所用的泵功率比陶瓷膜微滤所用的泵功率要小得多，因此综合能耗会大大降低，较陶瓷膜微滤法能耗下降70％以上；同时，该方法在得到阿卡波糖发酵滤液的同时能够把发酵滤渣的收集工作一并解决；方法简单易操作，对设备要求低，对环境友好，便于工业化生产。