本发明涉及分子育种技术领域，具体涉及一种同步改良棉花纤维长度和强度的分子育种方法，该方法用分子标记SSRGL16250bp可以在苗期预测纤维长度和强度的高低并进行淘汰，获得纤维长度和强度同时得到提高的陆地棉单株或品系或品种，提高纤维长度和强度性状的选择效率，辅助育种选择目标明确，节约成本。本发明有助于克服现有育种技术对纤维长度和强度表型性状鉴定存在的选择准确性差、效率低、周期长、成本高等许多不足，能同步改良纤维长度和强度性状，提高选择效率，加快纤维优质新品种的培育进程。