本发明涉及中药鉴定技术领域，具体为一种园参，林下参和野山参SSR指纹图谱及鉴定方法。园参，林下参和野山参SSR指纹图谱包括DNA提取、PCR扩增、PCR产物鉴定，最终构建园参，林下参和野山参SSR指纹图谱；园参，林下参和野山参SSR指纹鉴定方法包括园参，林下参和野山参SSR标准指纹图谱的建立、样品DNA指纹图谱的建立、利用多态性比对进行结果鉴定。该指纹图谱及鉴定方法可用于园参，林下参和野山参样品的鉴定。本发明能从基因组特征上对园参，林下参和野山参进行真伪鉴定，鉴定方法具有简便、快速、结果可靠和重复性高等优点。