本发明属于河床含水层渗透系数测量技术领域，公开了一种原位测量河床含水层渗透系数装置，包括钻井管、水箱和控制器，钻井管开设有泄压孔，钻井管连接有井管护帽，井管护帽连接有测距仪，水箱连通有导水管，导水管连接有数字流量计，数字流量计和测距仪均与控制器连接；还公开了一种原位测量河床含水层渗透系数的方法，包括S1：基础参数的获取；S2：测量装置的连接；S3：测量前的准备；S4：开始测量；S5：计算渗透系数；本发明解决了现有技术测量含水层渗透系数精度低、费用高、耗时多的问题，可实现测量数据的远程传输与远程控制，节约了人力成本，适用于野外含水层渗透系数的测量。