本发明属于生物医药领域，具体为一种肾透明细胞癌生物标志物及其在早期筛查中的应用。本发明通过收集肾透明细胞癌患者的癌组织及癌旁组织，通过LC‑MS代谢组学分析，发现了能够早期筛查肾透明细胞癌的生物标志物。考虑到单个差异代谢物诊断效能有限，本发明还进一步构建了联合诊断模型，其诊断效能明显优于单个代谢物的诊断效能，可以通过检测患者生物样本中联合诊断模型代谢标志物的含量，判断受试者是否患有肾透明细胞癌以及患肾透明细胞癌的风险，实现癌症早期的筛查，从而在癌症早期进行干预治疗，提高患者的生存质量。