本发明公开了一种移动智能终端的复杂背景指印鉴定方法，包括如下步骤：1)基于移动智能设备获取的复杂指印快照进行下采样和图像对比度增强；2)基于预处理后的原始图像截取指印局部块序列；3)使用经过剪枝优化的基于多尺度残差结构的特征提取网络进行置信度预测并得到对应的局部块置信度序列；4)基于指印局部块序列计算局部块质量序列，使用基于图像质量的分数融合策略联合计算移动智能终端的复杂背景指印最终预测概率。本发明的方法基于移动智能终端自动运行，实现复杂背景指印随时随地鉴定的目的，不依赖高精度的专业设备，打破了时间和空间的局限，降低了设备成本和劳动力成本；基于多尺度深度神经网络保障了该方法具有很高的性能。