本发明属于电力领域，尤其涉及一种电力系统数据安全处理方法和系统，方法包括设置主服务器，输出经过第一数据；设置中继服务器，获取并二次加密所述第一数据，输出第二数据；设置解密装置，接受第二数据并解密输出第三数据；设置客户端，解密第三数据；设置镜像服务器暂时替主服务器存储外网输入数据；设置数据记录模块，接收密钥信息，并在接收完成时与主服务器物理隔离。通过设置用于随机加密的主服务器，能够提供对数据的一层加密保护；通过中继服务器能够提供对数据的二层加密保护且增加对主服务器防护；通过解密装置能够使数据能够被正常解读；通过客户端能够完成数据交互；通过镜像服务器能增加主服务器的防御能力。