本发明公开了一种网络操作系统中应用内生安全数据库存取方法和装置，所述内生安全数据库基于异构数据体进行设计，具体如下步骤：步骤S1、网络操作系统与内生安全数据库之间通过安全通信机制进行交互，不被监听和攻击；步骤S2、将数据分发到字典数据结构的异构键值空间中；步骤S3、从异构编码后的数据中选择正确的数据；步骤S4、通过数据持久化模块对数据进行保存，所述数据持久化模块用于对普通数据体的持久化和对异构数据体的持久化。本发明实现各个数据体之间的相互隔离，攻击者无法通过任意数据体获得其他异构备份的信息，从而极大提高攻击成本。本发明是完全独立于硬件结构的轻量化软件设计，可以在绝对大多数平台上移植应用。