本发明公开了一种高通量荷正电复合纳滤膜、制备方法及应用，涉及膜分离技术领域，其中，一种高通量荷正电复合纳滤膜，包括基膜和形成于基膜表面的活性层，活性层由水相溶液和油相溶液通过界面聚合反应后再经热处理形成；水相溶液为水相单体溶于水的溶液，油相溶液为酰氯单体溶于有机溶剂的溶液，所述水相单体的结构通式为：其中，R为‑OH或‑NH2。本申请的复合纳滤膜，不仅通量高，且具有高强度的荷正电，可以有效提高对钙镁离子、重金属阳离子的去除效率，更适用于作为饮用水终端处理，实现饮用水的软化及净化处理。