本发明公开了一种柔性透明聚酰亚胺薄膜及其制备方法，其中，该制备方法通过以下步骤实现：1)将无机纳米填料加入到溶剂中进行超声分散，得到分散液；2)将4，4'‑(1，3‑次苯基二氧)二苯胺加入至所述分散液中进行溶解，得到中间混合液；3)将4，4'‑六氟异丙基邻苯二甲酐加入至所述中间混合液中，通过聚合反应得到聚酰胺溶液；4)对所述聚酰胺溶液聚酰胺溶液进行热固化反应，即得到所述柔性透明聚酰亚胺薄膜。采用本发明制备方法获得的聚酰亚胺薄膜不仅有效地改善了聚酰亚胺与无机纳米颗粒之间的界面结合性能，使无机纳米颗粒能够更均匀地分散在聚酰亚胺膜基体中，而且赋予聚酰亚胺薄膜更加优良的综合性能，同时，还有效的增加了聚酰亚胺薄膜的使用广泛性。