本发明提出了一种加氢生产环保型生物柴油的方法，属于生物柴油技术领域，将废弃植物油预处理后，在第一催化剂的作用下发生酯交换反应，得到脂肪酸甲酯，进一步在第二催化剂的作用下发生加氢脱氧反应，得到的气液混合物在气液分离装置中分离成液相产物和气相产物，所述液相产物通过油水分离装置分离，得到环保型生物柴油。本发明制得的环保型生物柴油可替代柴油，具有高的十六烷值，低凝点等特点，节能环保，制备方法简单，反应条件温和，成本低，易于实现产业化。