本发明涉及一种基于双端零序电流比的高阻接地故障纵联保护方法及装置，该方法包括获取小电阻接地配电网系统发生单相接地故障线路的上游零序电流和下游零序电流；若上游零序电流大于小电阻接地配电网系统的最大不平衡电流，则根据上游零序电流和下游零序电流计算，获得零序电流比；若零序电流比满足保护判据，则延时时间T后，控制小电阻接地配电网系统的保护开关动作，切除故障线路。该方法通过获取小电阻接地配电网系统发生单相接地故障线路的上游零序电流和下游零序电流，在满足上游零序电流大于最大不平衡电流条件下计算零序电流比，通过零序电流比满足保护判据情况下控制保护开关动作切断故障线路，实现对小电阻接地配电网系统的故障保护。