本发明属于光伏发电技术领域，涉及一种光伏串短路保护方法及装置，该方法基于太阳能光伏电池的等效电路模型以及相应的出口电流电压特征方程，得到在故障后的故障光伏串的输出电流、输出电压，以及故障电池数量的数学解析关系；计算出故障电池数量的整定值；采用移动窗口计算光伏串的输出电流和光伏串的输出电压的暂态变化作为保护启动条件；以故障后光伏串的输出电流反向或者故障电池数量达到故障电池数量的整定值为保护判据，执行保护动作。本发明基于光伏阵列线间故障时光伏串输出电流突变以及故障电池数量的保护判据，可快速准确地定位光伏阵列中的故障光伏串。