本发明涉及一种砂泥互层水力压裂穿透隔层的模拟方法，包括：测量不同层位和不同岩性的地质参数，获得隔层地质参数测量结果；根据所述隔层地质参数测量结果，建立砂泥互层三维本构模型；根据井段地层情况，从所述砂泥互层三维本构模型中确定几何参数，进行网格划分并且设置计算单元，在所述计算单元中嵌入零厚度粘聚力裂缝单元，以获得单元网格；改变不同隔层厚度下的所述砂泥互层本构模型的排量和粘度，建立多组数值模型，对所述多组数值模型进行有限元计算，获得对应于所述排量和所述粘度的能够穿透隔层的裂缝的缝长和缝宽。能够对比不同组合穿透隔层时所对应的裂缝形态，优选出最佳的排量和粘度。