本公开提供了一种玻璃瓶底瑕疵图像检测剔除装置、系统及方法，属于图像瑕疵检测领域，包括采集待检测玻璃瓶的瓶底普通图像和应力图像；获取采集的玻璃瓶底部的普通图像和应力图像，对所述图像分别在不同深度的模型中进行特征提取，获取不同深度的特征图；对不同深度的特征图进行融合，当一个融合节点具有多个输入特征图时，将给每个输入的特征图自动分配权重，融合不同层次的特征图；对融合的特征图进行瑕疵检测，获取瑕疵玻璃瓶并进行剔除；省了大量人工调参的误差，简化了操作流程，大大降低了瑕疵的漏检率，提升了检测效率；有效避免数据流的混乱以及板卡损耗率高，易出现设备各模块工作不同步的现象，大大提升设备的自动化水平。