本发明属于微生物应用技术领域，具体公开了产红青霉菌PR1菌丝提取物的应用，具体为用于提高番茄植株对根结线虫的抗性和提升果实品质；本发明所述产红青霉菌PR1菌丝提取物可以诱导番茄植株产生免疫反应，抑制根结线虫的侵染，给线虫入侵植物根部造成困难，提高了植物对根结线虫的抗性，减少了化学药剂的使用，降低了农药残留；且所述产红青霉菌PR1菌丝提取物可以增加果实中维生素C、可溶性糖和游离氨基酸等营养物质的含量，促进营养物质的积累，提升果实品质；本发明所述产红青霉菌PR1菌丝提取物的绝对用量少，仅需5ng/mL~100ng/mL即可对根结线虫产生很好地防效，显著提升果实品质，极大地降低了使用成本低。