本发明提供了一种多级孔MRE分子筛的制备方法。该方法由硅源、铝源、无机碱、模板剂、有机添加剂、水，充分混合后通过水热晶化法一步制备多级孔MRE分子筛。其所用的有机添加剂为四甲基氢氧化铵、四甲基氯化铵、四甲基溴化铵、四甲基氟化铵、四乙基溴化铵、四乙基氯化铵、四乙基氢氧化铵、四乙基氟化铵中的一种或多种。该方法制备的MRE分子筛呈高度分散的纳米棒状形貌，直径15～200nm，长400～2000nm，总孔容大于0.5cm3/g。通过该方法可以通过一步水热晶化制备得到高结晶度的多级孔MRE分子筛，是一种简便、经济、高效的多级孔MRE分子筛制备方案。