本文涉及区块链技术领域，尤其涉及一种基于区块链的跨链身份验证方法及系统。包括，第一区块链和第二区块链分别将第一用户和第二用户的身份信息发送到中继链；中继链利用第一算法分别对第一用户的身份信息和第二用户的身份信息进行注册；得到第一用户的身份标识、第一用户的私钥以及第一区块链的身份标识、第二用户的身份标识、第二用户的私钥以及第二区块链的身份标识；第一区块链将第一用户根据第一用户的身份标识、第一用户的私钥生成的数字签名；第二区块链将第二用户利用第一用户的公钥对第一用户的数字签名进行验证。通过本文实施例，实现了中继链对跨区块链用户的身份进行管控。解决了现有技术中存在跨域身份管理可信评价难等问题。