本发明公开的一种基于深度学习的智慧供热节能调控方法、系统及存储介质，包括：获取目标区域内热用户的历史供热数据信息及目标区域的气象数据信息，基于深度学习构建热负荷预测模型，根据所述历史供热数据信息结合气象数据信息通过热负荷预测模型获取目标区域的热负荷，根据目标区域内预设时间后的热负荷预测值通过模糊决策生成调控方案，对目标区域热网系统的二次网供热温度进行调节，获取目标区域内的室温分布图及供热数据变化曲线，根据所述室温分布图及供热数据变化曲线进行故障诊断，判断当前供热设备的运行状态。本发明通过制定调控方案避免了区域性的供热调控不均问题，同时根据动态预测实现动态节能，提供了更好的供热服务质量。