本发明公开了一种检测监控重点区域车辆的方法系统，包括重点地区库、信息合成模块、过滤条件设置模块和收费站出口车辆通行数据采集模块；所述重点地区库将动态提供全国范围内被列为重点地区的信息，并把该信息动态提供给信息合成模块；所述信息合成模块负责把全国范围内高速公路收费站识别码同重点地区库模块提供的重点地区列表相关信息进行关联合成；所述过滤条件设置模块负责对信息合成模块生成的重点地区收费站列表进行信息过滤。该发明通过Web监控展示平台和手持终端模块的设置，其中Web监控展示平台负责对重点车辆进入监控区域范围的告警信息、车辆实时位置跟踪监控信息、车辆在监控区域范围内驶出高速信息进行展示。