本发明涉及防治菌株实验技术领域，且公开了一种植物病害生物防治菌株的筛选方法，所述筛选方法包括以下步骤：S1：筛选培养基；S2：制备锭粉培养基后，进行紫外线灭菌20min；S3：制备土壤稀释液，选取果园内、花坛地方的土样，铲产去表层，取5～15CMM处5克的土壤样品，加入事先灭菌好的装有100mL无菌水的250mL的三角瓶内，30℃恒温振荡200rpm，将菌胶团打碎，得泥水混合物，备用；S4：将泥水混合物转入装有100mL筛选培养基的500mL锥形瓶中，30℃恒温静置培养至培养基浑浊，得到菌悬液；S5：获得菌种；S6：单个菌种初筛；S7：接种到斜面培养基中，放入37℃的恒温培养箱中培养2～7天，得到枯草芽孢杆菌防治菌株再加入苹果植物苗。