本申请涉及水样检测装置技术领域，具体而言，涉及一种渠道原状水体分层采样、流量获取装置及方法，一定程度上可以解决水体分层采样时效率低且流量测量精度差的问题。所述装置包括抽水机构，抽水机构包括外管和输水管，所述外管开设有贯穿的多个通水孔，所述通水孔的高度不同，所述输水管位于所述外管的内部，且所述输水管的一端与通水孔连通；控制机构，与所述输水管的另一端连通且用于控制不同高度所述输水管抽水；流量测量机构，与所述抽水机构连接且用于测量渠道水流的瞬时流量。