本发明提供一种综合能源变电站的优化配置方法，包括以下步骤：获取综合能源变电站内各个设备的单位造价和综合能源变电站的运行成本；根据综合能源变电站内各个设备的单位造价和综合能源变电站的运行成本，以最低化综合能源变电站的全寿命周期投资成本为目标建立目标函数；获取综合能源变电站内各个设备的占地面积和电参数；根据综合能源变电站内各个设备的占地面积和电参数，设置约束条件；根据目标函数和约束条件建立优化模型；通过求解器求解优化模型，以得到综合能源变电站的优化配置方案。本发明能够在满足各类能源需求的基础上，减少综合能源变电站的总成本，实现经济、低碳、高效、安全等目标。