本发明提出了一种地基沉降预测系统和沉降预测方法，该系统包括数据采集模块、数据传输模块和数据处理模块；数据采集模块监测沉降量，并将获取的沉降量通过数据传输模块传输至数据处理模块；数据处理模块构建用于沉降量预测的三维整体模型；并在模型中输入有限元计算初始参数，通过有限元分析模拟沉降量；将模拟沉降量与监测沉降量对比，根据对比的误差调整有限元计算参数，并利用调整后有限元计算参数进行重复模型计算，直至误差小于阈值为匹配的最终计算参数，保存调整后的三维整体模型及最终计算参数，用于变电站场地的沉降预测。基于该系统，还提出了一种地基沉降预测方法。本发明实现对变电站内的主要建筑物进行沉降自动观测和预警。