本发明公开的属于PEN薄膜加工技术领域，具体为一种氢能源燃料电池PEN薄膜冲切方法及设备，包括具体步骤如下：将放置组件放置在前进组件的最左侧上，并使加工台右侧的吸盘位于定位组件的正下方，此时，将PEN薄膜的一端贴合在加工台右侧的吸盘上，以实现通过吸附组件将PEN薄膜的一端吸附固定在加工台的右侧上，通过前进组件使加工台进行移动，本发明通过换位组件将已完成加工程序的放置组件移至到初始位置处，并再通过定位组件将PEN薄膜的一端定位在放置组件上，具有实现机械化上料的作用，通过实现机械化上料，从而会进一步提高工作效率，以及还会进一步降低劳动强度。