本申请涉及一种毛细管电泳的样品浓缩装置，涉及毛细管电泳设备领域，包括第一壳体、第二壳体，所述第一壳体与第二壳体之间活动连接，所述第二壳体的内部空腔靠近中间位置固定安装有伸缩杆，所述伸缩杆的上端外表面固定安装有连接板，所述第二壳体的内地面对称设置有两组试管，所述第一壳体的内顶面对称固定安装有两组伸缩杆，所述活塞的上端外表面靠近中间位置贯穿连接有毛细管；本发明通过设置第一辅助机构，可以避免现有技术中毛细管电泳设备在使用后，对毛细管进行清理时，大部分都先将毛细管拆卸，再通过人工进行清理，进而在对毛细管进行清理时，需要的人工成本高，且操作麻烦的问题。